Mùa thu, khi thời tiết bắt đầu se lạnh và ngày ngắn lại, cây cối thường có những thay đổi lớn về mặt sinh trưởng. Các cây lá rụng, chẳng hạn như cây phong hay cây sồi, sẽ bắt đầu giảm quá trình quang hợp khi lượng ánh sáng mặt trời giảm và nhiệt độ hạ xuống. Lượng chlorophyll (sắc tố xanh) trong lá giảm dần, khiến lá chuyển sang màu vàng, cam, đỏ, hoặc nâu trước khi rụng.
Cây cối bước vào giai đoạn nghỉ đông, trong đó sự sinh trưởng chậm lại hoặc dừng hẳn để tiết kiệm năng lượng. Rễ cây vẫn tiếp tục hút nước và chất dinh dưỡng từ đất, nhưng cây không phát triển lá mới hoặc tăng chiều cao như trong mùa xuân và mùa hè.
Cây thường dành mùa thu để dự trữ năng lượng trong rễ và thân, chuẩn bị cho mùa đông khắc nghiệt sắp tới. Điều này giúp cây tồn tại qua mùa đông và sẵn sàng bùng nổ sinh trưởng trở lại khi mùa xuân đến.